MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 1414

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008765	TCGCT	2	10	48790	48799	0 %	40 %	20 %	40 %	121582522
1002	NC_008765	TCA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582523
1003	NC_008765	TGC	2	6	50372	50377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582523
1004	NC_008765	GCCA	2	8	50387	50394	25 %	0 %	25 %	50 %	121582523
1005	NC_008765	GC	3	6	50551	50556	0 %	0 %	50 %	50 %	121582523
1006	NC_008765	GAACC	2	10	50562	50571	40 %	0 %	20 %	40 %	121582523
1007	NC_008765	CAA	2	6	50584	50589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582523
1008	NC_008765	TGC	2	6	50615	50620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582523
1009	NC_008765	CGTT	2	8	50850	50857	0 %	50 %	25 %	25 %	121582523
1010	NC_008765	TCG	2	6	50862	50867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582523
1011	NC_008765	GGC	3	9	50877	50885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582523
1012	NC_008765	GCC	2	6	50914	50919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582523
1013	NC_008765	TGC	2	6	50922	50927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582523
1014	NC_008765	GCC	2	6	50996	51001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582523
1015	NC_008765	CTT	2	6	51127	51132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582523
1016	NC_008765	GCCG	2	8	51238	51245	0 %	0 %	50 %	50 %	121582523
1017	NC_008765	GCC	3	9	51256	51264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582523
1018	NC_008765	GCA	2	6	51501	51506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582524
1019	NC_008765	TGC	2	6	51510	51515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582524
1020	NC_008765	G	6	6	51517	51522	0 %	0 %	100 %	0 %	121582524
1021	NC_008765	TG	3	6	51618	51623	0 %	50 %	50 %	0 %	121582524
1022	NC_008765	GC	3	6	51651	51656	0 %	0 %	50 %	50 %	121582524
1023	NC_008765	TCG	2	6	51786	51791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582524
1024	NC_008765	GC	3	6	51845	51850	0 %	0 %	50 %	50 %	121582525
1025	NC_008765	CA	3	6	51885	51890	50 %	0 %	0 %	50 %	121582525
1026	NC_008765	GCA	2	6	51891	51896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582525
1027	NC_008765	ACC	2	6	52031	52036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582525
1028	NC_008765	CTT	2	6	52063	52068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582525
1029	NC_008765	TCT	2	6	52252	52257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582526
1030	NC_008765	AGC	2	6	52313	52318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582526
1031	NC_008765	CGT	2	6	52379	52384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582526
1032	NC_008765	GGC	2	6	52409	52414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582526
1033	NC_008765	GCT	2	6	52432	52437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582526
1034	NC_008765	CCA	2	6	52483	52488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582526
1035	NC_008765	GT	3	6	52528	52533	0 %	50 %	50 %	0 %	121582526
1036	NC_008765	TGCGG	2	10	52538	52547	0 %	20 %	60 %	20 %	121582526
1037	NC_008765	TTC	2	6	52731	52736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1038	NC_008765	CTT	2	6	52779	52784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1039	NC_008765	AAG	2	6	52843	52848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582527
1040	NC_008765	GAA	2	6	52917	52922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582527
1041	NC_008765	TTC	2	6	52956	52961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1042	NC_008765	CAG	2	6	52971	52976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1043	NC_008765	CGG	3	9	53000	53008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582527
1044	NC_008765	TCG	2	6	53033	53038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1045	NC_008765	GGC	3	9	53064	53072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582527
1046	NC_008765	GTC	2	6	53094	53099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1047	NC_008765	TTC	2	6	53163	53168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1048	NC_008765	TCT	2	6	53183	53188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1049	NC_008765	TCT	2	6	53207	53212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1050	NC_008765	GCG	2	6	53232	53237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582527
1051	NC_008765	TGC	2	6	53254	53259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1052	NC_008765	TCG	2	6	53299	53304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1053	NC_008765	CG	3	6	53303	53308	0 %	0 %	50 %	50 %	121582527
1054	NC_008765	GCA	2	6	53396	53401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1055	NC_008765	CGC	2	6	53411	53416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582527
1056	NC_008765	CAG	2	6	53430	53435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1057	NC_008765	GCG	2	6	53457	53462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582527
1058	NC_008765	GTC	2	6	53580	53585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1059	NC_008765	GTT	2	6	53592	53597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582527
1060	NC_008765	GGC	2	6	53612	53617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582527
1061	NC_008765	CTT	2	6	53640	53645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1062	NC_008765	GAT	2	6	53646	53651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582527
1063	NC_008765	CCAGC	2	10	53666	53675	20 %	0 %	20 %	60 %	121582527
1064	NC_008765	GCG	2	6	53678	53683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582527
1065	NC_008765	CGA	2	6	53705	53710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582527
1066	NC_008765	CTT	2	6	53732	53737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1067	NC_008765	CAC	2	6	53742	53747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582527
1068	NC_008765	GAT	2	6	53757	53762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582527
1069	NC_008765	TCC	2	6	53791	53796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582527
1070	NC_008765	CGGC	2	8	53861	53868	0 %	0 %	50 %	50 %	121582527
1071	NC_008765	CGG	2	6	53897	53902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582527
1072	NC_008765	CTT	2	6	53928	53933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582527
1073	NC_008765	GTTG	2	8	53934	53941	0 %	50 %	50 %	0 %	121582527
1074	NC_008765	TGTCCT	2	12	53954	53965	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	121582527
1075	NC_008765	GGC	2	6	54018	54023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582528
1076	NC_008765	CGC	2	6	54038	54043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582528
1077	NC_008765	CAC	2	6	54114	54119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582528
1078	NC_008765	TCG	2	6	54130	54135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582528
1079	NC_008765	GCG	2	6	54168	54173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582528
1080	NC_008765	CAG	2	6	54192	54197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582528
1081	NC_008765	TTCCA	2	10	54220	54229	20 %	40 %	0 %	40 %	121582528
1082	NC_008765	TGC	2	6	54232	54237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582528
1083	NC_008765	CG	4	8	54239	54246	0 %	0 %	50 %	50 %	121582528
1084	NC_008765	CAC	2	6	54306	54311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582528
1085	NC_008765	GCG	2	6	54319	54324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582528
1086	NC_008765	GAT	2	6	54369	54374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582528
1087	NC_008765	CAGCG	2	10	54405	54414	20 %	0 %	40 %	40 %	121582528
1088	NC_008765	CG	3	6	54413	54418	0 %	0 %	50 %	50 %	121582528
1089	NC_008765	GCGG	2	8	54437	54444	0 %	0 %	75 %	25 %	121582528
1090	NC_008765	CCA	2	6	54455	54460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582528
1091	NC_008765	CCA	2	6	54476	54481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582528
1092	NC_008765	TCG	2	6	54565	54570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582528
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1094	NC_008765	GGT	2	6	54699	54704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582528
1095	NC_008765	GCC	2	6	54782	54787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582529
1096	NC_008765	GCGCG	2	10	54869	54878	0 %	0 %	60 %	40 %	121582529
1097	NC_008765	GCC	2	6	54892	54897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582529
1098	NC_008765	TTG	2	6	54953	54958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582529
1099	NC_008765	CTT	2	6	55006	55011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582529
1100	NC_008765	GTC	2	6	55018	55023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582529
1101	NC_008765	GTC	2	6	55084	55089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582529
1102	NC_008765	GTA	2	6	55187	55192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582529
1103	NC_008765	GA	5	10	56361	56370	50 %	0 %	50 %	0 %	121582530
1104	NC_008765	GCA	2	6	56390	56395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582530
1105	NC_008765	GAG	2	6	56400	56405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582530
1106	NC_008765	CAA	2	6	56448	56453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582530
1107	NC_008765	CGC	3	9	56488	56496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582530
1108	NC_008765	GCC	2	6	56599	56604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582530
1109	NC_008765	CA	3	6	56809	56814	50 %	0 %	0 %	50 %	121582531
1110	NC_008765	CAAT	2	8	56903	56910	50 %	25 %	0 %	25 %	121582531
1111	NC_008765	GCA	2	6	57046	57051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582531
1112	NC_008765	CAA	2	6	57109	57114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582531
1113	NC_008765	GAGC	2	8	57147	57154	25 %	0 %	50 %	25 %	121582531
1114	NC_008765	CGA	2	6	57186	57191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582531
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1117	NC_008765	CGC	2	6	57342	57347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582531
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1119	NC_008765	CG	3	6	57558	57563	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
1120	NC_008765	GCC	2	6	57579	57584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582531
1121	NC_008765	GC	3	6	57613	57618	0 %	0 %	50 %	50 %	121582531
1122	NC_008765	TTC	2	6	57638	57643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582531
1123	NC_008765	CAC	3	9	57657	57665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582531
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1125	NC_008765	GCT	2	6	57768	57773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582531
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1247	NC_008765	TGCGC	2	10	63866	63875	0 %	20 %	40 %	40 %	121582538
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1377	NC_008765	CG	3	6	70039	70044	0 %	0 %	50 %	50 %	121582545
1378	NC_008765	CG	4	8	70060	70067	0 %	0 %	50 %	50 %	121582545
1379	NC_008765	GGC	2	6	70076	70081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582545
1380	NC_008765	CG	3	6	70159	70164	0 %	0 %	50 %	50 %	121582545
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1384	NC_008765	TGGC	2	8	70601	70608	0 %	25 %	50 %	25 %	121582546
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